Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms