Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHD4Q14839 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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