Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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RFTN1Q14699 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RFTN1Q14699 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RFTN1Q14699 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RFTN1Q14699 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFTN1Q14699 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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