Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BFSP2Q13515 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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