Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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