Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TOP3AQ13472 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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TOP3AQ13472 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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