Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE3BQ13370 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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