Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP2Q13309 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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