Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM28Q13263 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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