Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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IFT88Q13099 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFT88Q13099 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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