Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPRJQ12913 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRJQ12913 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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