Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FAM27E3Q08E93 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FAM27E3Q08E93 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FAM27E3Q08E93 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM27E3Q08E93 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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