Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLFN5Q08AF3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms