Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms