Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FMODQ06828 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms