Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms