Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms