Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYP27A1Q02318 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms