Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms