Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms