Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB1P82279 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB1P82279 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB1P82279 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms