Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMF1P82094 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMF1P82094 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMF1P82094 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMF1P82094 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TMF1P82094 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMF1P82094 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms