Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HBBP68871 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HBBP68871 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HBBP68871 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HBBP68871 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HBBP68871 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HBBP68871 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HBBP68871 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HBBP68871 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HBBP68871 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HBBP68871 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HBBP68871 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HBBP68871 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms