Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERVK_113P62684 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms