Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBE2NP61088 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
UBE2NP61088 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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