Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVPABLB-1P60509 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms