Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFC1P60507 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms