Protein–RNA interactions for Protein: P57730

CARD18, Caspase recruitment domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD18P57730 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CARD18P57730 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CARD18P57730 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CARD18P57730 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms