Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CASP6P55212 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP6P55212 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP6P55212 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP6P55212 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP6P55212 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP6P55212 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP6P55212 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP6P55212 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP6P55212 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP6P55212 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP6P55212 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP6P55212 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP6P55212 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms