Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1P52655 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms