Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC3P51654 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPC3P51654 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPC3P51654 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPC3P51654 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPC3P51654 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC3P51654 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms