Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIP4K2AP48426 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms