Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RANGAP1P46060 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms