Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF9P41273 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF9P41273 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms