Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZEB1P37275 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms