Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARGP37231 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PPARGP37231 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARGP37231 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARGP37231 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms