Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJC1P36383 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJC1P36383 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJC1P36383 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms