Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP6P35125 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP6P35125 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP6P35125 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP6P35125 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP6P35125 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP6P35125 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6P35125 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6P35125 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms