Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA10P31260 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA10P31260 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms