Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR2AP28223 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms