Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB4P28070 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms