Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IL3RAP26951 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IL3RAP26951 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms