Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPREP23469 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPREP23469 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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