Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRDP23468 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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