Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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