Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms