Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGB6P18564 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms