Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms