Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TMEM225BP0DP42 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TMEM225BP0DP42 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TMEM225BP0DP42 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TMEM225BP0DP42 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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