Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD3P0DMS9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms